Orígenes del coronavirus: el análisis del genoma sugiere que dos virus pueden haberse combinado

Imagen vía Michal Ico / Unsplash

¿Puede Satanás darme lo que quiero?

Este artículo de Alexandre Hassanin se vuelve a publicar aquí con el permiso de La conversación . Este contenido se comparte aquí porque el tema puede interesar a los lectores de Snopes; sin embargo, no representa el trabajo de los verificadores o editores de Snopes.




En el espacio de unas pocas semanas, todos hemos aprendido mucho sobre COVID-19 y el virus que lo causa: SARS-CoV-2. Pero también ha habido muchos rumores. Y si bien el número de artículos científicos sobre este virus está aumentando, todavía existen muchas áreas grises en cuanto a su origen.



¿En qué especie animal ocurrió? ¿Un murciélago, un pangolín u otra especie salvaje? ¿De dónde viene? ¿De una cueva o un bosque en la provincia china de Hubei o de otro lugar?

En diciembre de 2019, 27 de las primeras 41 personas hospitalizadas (66%) pasaron por un mercado ubicado en el corazón de la ciudad de Wuhan en la provincia de Hubei. Pero, de acuerdo con un estudio realizado en el Hospital de Wuhan , el primer caso humano identificado no frecuentaba este mercado. En lugar de, una estimación de la datación molecular basada en las secuencias genómicas del SARS-CoV-2 indica un origen en noviembre. Esto plantea preguntas sobre el vínculo entre esta epidemia de COVID-19 y la vida silvestre.



Datos genómicos

La Genoma del SARS-CoV-2 fue secuenciada rápidamente por investigadores chinos. Es un ARN molécula de aproximadamente 30,000 bases que contiene 15 genes, incluido el gen S que codifica una proteína ubicada en la superficie de la envoltura viral (en comparación, nuestro genoma tiene la forma de una doble hélice de ADN de aproximadamente 3 mil millones de bases de tamaño y contiene unos 30.000 genes).

El invierno más frío que he pasado fue el verano en San Francisco.

Comparativo análisis genómicos han demostrado que el SARS-CoV-2 pertenece al grupo de Betacoronavirus y que esta muy cerca de SARS-CoV , responsable de una epidemia de neumonía aguda que apareció en noviembre de 2002 en la provincia china de Guangdong y luego se extendió a 29 países en 2003. Se registraron un total de 8.098 casos, incluidas 774 muertes. Se sabe que los murciélagos del género Rhinolophus (potencialmente varias especies de cuevas) fueron las reservorio de este virus y que un pequeño carnívoro, la civeta de palma ( Paguma larvata ), puede haber servido como anfitrión intermedio entre murciélagos y los primeros casos humanos.

Desde entonces, muchos Betacoronavirus se han descubierto, principalmente en murciélagos, pero también en humanos. Por ejemplo, RaTG13, aislado de un murciélago de la especie Relacionado con Rhinolophidae recogido en la provincia china de Yunan, se ha descrito recientemente como muy similar al SARS-CoV-2, con secuencias del genoma idénticas al 96% . Estos resultados indican que los murciélagos, y en particular las especies del género Rhinolophus , constituyen el reservorio de los virus SARS-CoV y SARS-CoV-2.



Uno, Relacionado con Rhinolophidae .
Alexandre Hassanin,Autor proporcionado

Pero, ¿cómo se define un embalse? Un reservorio es una o varias especies animales que no son o no muy sensibles al virus, que naturalmente albergarán uno o varios virus. La ausencia de síntomas de la enfermedad se explica por la eficacia de su sistema inmunológico, que les permite luchar contra una proliferación viral excesiva.

Mecanismo de recombinación

El 7 de febrero de 2020, nos enteramos de que se había descubierto en el pangolín un virus aún más cercano al SARS-CoV-2. Con el 99% de concordancia genómica reportada , esto sugirió un reservorio más probable que los murciélagos. Sin embargo, un estudio reciente en revisión muestra que el genoma del coronavirus aislado del pangolín de Malasia ( Manis javanica ) es menos similar al SARS-Cov-2, con solo el 90% de concordancia genómica. Esto indicaría que el virus aislado en el pangolín no es responsable de la epidemia de COVID-19 que se está propagando actualmente.

¿Tom Selleck está dejando Blue Bloods?

Sin embargo, el coronavirus aislado de pangolín es similar al 99% en una región específica de la proteína S, que corresponde a los 74 aminoácidos involucrados en el dominio de unión al receptor de la ECA (Enzima Convertidora de Angiotensina 2), el que permite la entrada del virus. células humanas para infectarlas. Por el contrario, el virus RaTG13 aislado de murciélago R. relacionado es muy divergente en esta región específica (sólo el 77% de similitud). Esto significa que el coronavirus aislado de pangolín es capaz de entrar en células humanas, mientras que el aislado de murciélago R. relacionado no es.

Además, estas comparaciones genómicas sugieren que el virus SARS-Cov-2 es el resultado de una recombinación entre dos virus diferentes, uno cercano a RaTG13 y el otro más cercano al virus del pangolín. En otras palabras, es una quimera entre dos virus preexistentes.

Un coronavirus del pangolín podría ser una de las fuentes de COVID-19.
Wildlife Alliance / Flickr , CC BY

Este mecanismo de recombinación había ya ha sido descrito en coronavirus, en particular para explicar el origen del SARS-CoV. Es importante saber que la recombinación da como resultado un nuevo virus potencialmente capaz de infectar una nueva especie huésped. Para que se produzca la recombinación, los dos virus divergentes deben haber infectado al mismo organismo simultáneamente.

Quedan sin respuesta dos preguntas: ¿en qué organismo se produjo esta recombinación? (¿un murciélago, un pangolín u otra especie?) Y sobre todo, ¿en qué condiciones se produjo esta recombinación?

comercial de at & t milana vayntrub

Alexandre Hassanin , Profesor Asociado (HDR) en la Universidad de la Sorbona, ISYEB - Instituto de Sistemática, Evolución, Biodiversidad (CNRS, MNHN, SU, EPHE, UA), Museo Nacional de Historia Natural (MNHN)

Este artículo se vuelve a publicar desde La conversación bajo una licencia Creative Commons. Leer el artículo original .